يتمتع د. محمد نبيل بخبرة في تشخيص وعلاج مختلف أمراض الجهاز الهضمي والكبد، مع اهتمام خاص بأمراض المعدة والقولون، وجرثومة المعدة، وأمراض الكبد والفيروسات الكبدية.

تشمل خبرته علاج التهاب المعدة الحاد والمزمن والقولون العصبي، وتشخيص وعلاج جرثومة المعدة ومتابعة التحاليل، بالإضافة إلى علاج السمنة وتركيب وإزالة بالون المعدة بالمنظار.

كما تشمل خبرته تشخيص وعلاج التهابات وفيروسات الكبد (A، B، C)، والتعامل مع حالات تليف الكبد ومضاعفاته، بما في ذلك الاستسقاء ودوالي المريء.